26 novembre 2007

Blague

Bonjour,
Ceci n'est pas une blague,
j'ai rendu le manuscrit de ma thèse,
j'ai passé les étapes administratives,
mes deux rapporteurs autorisent la soutenance,
et je vais enfin soutenir mon mémoire le 14 décembre,
pour pouvoir passer un Noël en paix, je l'espère.



Je vous envoie le résumé de mon travail en Frenchie et en Anglish.
La thèse aura lieu à l'intérieur du CEA de Cadarache, ce qui ne facilite pas les prises de rendez vous. Pour les courageux de la volonté qui veulent venir, il faut donc me contacter en avance pour que je puisse faire établir des avis de rendez vous.
Et puis, sinon, j'aurai une grosse excuse de moins pour ne pas vous offrir un coup ou ne pas vous accompagner pour faire le tour du monde.

Très sincèrement, et avec tous mes remerciements, à tous ceux qui m'ont supporté pendant ces 5 longues années.

Étude d'un déterminant de l'architecture racinaire chez Arabidopsis thaliana ; l'identité des cellules du péricycle associées aux pôles de xylème

Résumé:

L'initiation des racines latérales est un déterminant majeur de l'architecture de la racine. Ce travail caractérise l'assise cellulaire qui donne naissance aux racines latérales chez les plantes dicotylédonées ; le péricycle. Celui-ci est le plus souvent considéré comme une assise concentrique et homogène à l'instar des tissus plus externes. En revanche, les tissus cellulaires plus internes, qui incluent les éléments vasculaires, sont caractérisés par une organisation bilatérale. L'origine commune du péricycle et du cylindre central, ainsi que la capacité du péricycle à n'initier des racines latérales que de manière opposée aux pôles de xylème suggère cependant une intime association de ces tissus et une symétrie bilatérale du péricycle. En isolant et en caractérisant histologiquement deux lignées reportrices des cellules du péricycle adjacentes aux pôles de xylème, nous établissons que la nature bilatérale du péricycle se met en place très tôt au cours du développement. Un crible génétique réalisé sur l'une de ces deux lignées a permis d'isoler de nouveaux mutants altérés dans la détermination et la différentiation du péricycle. Leur analyse détaillée révèle une corrélation intime entre la détermination des cellules du péricycle et celle de leurs tissus vasculaires associés. Enfin, une approche d'étude du transcriptome a été réalisée qui permet de comparer l'expression des gènes dans l'une ou l'autre des populations de cellules du péricycle.

En conclusion, les résultats obtenus confirment l'idée selon laquelle le péricycle est composé de deux types de cellules différents. Nous proposons ainsi un nouveau modèle dans lequel la spécification des cellules du péricycle et des tissus vasculaires prend place très tôt au cours du développement, dépend de régulations génétiques communes, mais dans lequel les différentiations peuvent être, au moins partiellement, dissociées. Ceci modifie la vision classique de l'organisation des cellules du péricycle selon une structure bilatérale et non pas concentrique, dont l'identité est intimement reliée à celle des tissus vasculaires adjacents.

Study of a root architecture determinant: the identity of the pericycle cells associated with the xylem poles.

Lateral root initiation is a major determinant of root architecture. This work characterizes the pericycle cell layer from which the lateral roots emerge in the dicotyledonous plants. Up to now this layer has always been regarded, in accordance with the outer tissue layers, as one uniform concentric layer. This is in contrast with the diarch organization of the internal vascular tissues. However, the common origin of the pericycle and the vascular tissues, and the ability to initiate lateral roots restricted to the cells associated with the xylem poles indicate that these layers have both a bilateral symmetry and are intimately associated. We isolated and described two histological reporter lines for the pericycle cells associated with the xylem poles, and show that the determination of these pericycle cells happens early during the development. A genetic screen resulted in the isolation of mutants perturbed in pericycle differentiation. Detailed phenotypical analyses of two of these mutants combined with observations made in known vascular mutants revealed an intimate correlation between vascular organization, pericycle fate and lateral root initiation potency. At last, a transcriptome analysis was realized to compare the gene transcriptions level between the two populations of pericycle.

Taken together our data show that the pericycle is a heterogeneous cell layer with two populations of cells. We propose a model in which the vascular tissues and their associated pericycle are determined early, is dependent upon a common genetic pathway but which can differentiate, at least, independently. We therefore modify the classic vision of the pericycle cells following a bilateral organization and being intimately associated with their adjacent associated vascular tissues


Avec toute mon amitié.
Boris.

07 juillet 2007

Videomunication

La communication, l'enseignement par l'image: l'art de savoir réaliser ces films ou l'on essaie d'en dire le maximum en en disant le moins.
Ce site référence quelques docu du genre. POour moi c'est toujours un plaisir à regarder. Ce serait probablement un plaisir aussi de pouvoir participer à de tels projets...



AthenaWeb, c'est ici que cela se passe

19 juin 2007

Spleen du spin

A tout ceux qui auraient bien avalé un verre d'arsenic lorsqu'ils devaient apprendre comment se répartissent les électrons sur les différentes couches autour du noyau (oui je parle bien d'atomes) notamment pour apprendre le principe de la RMN (mais aussi pourquoi par devenir dieu), prenez ce lien, il est mon corps, il est mon sang !

>> Build an Atom

27 mai 2007

Modélimunication

Un site recueillant de multiples annimations illustrant simplement des concepts scitifiques scientifiques plutôt compliqués. Enfin bref, un bel exemple de communication.

C'est ici : demonstrations.wolfram.com via emob



Voici ce qu'on peux en lire, directement sur le site :
" Conceived by Mathematica creator and scientist Stephen Wolfram as a way to bring computational exploration to the widest possible audience, The Wolfram Demonstrations Project is an open-code resource that uses dynamic computation to illuminate concepts in science, technology, mathematics, art, finance, and a remarkable range of other fields."

22 mai 2007

C'est peu et c'est beaucoup

Voici trois liens dont j'aimerai particulièrement vous faire part.



Le premier, probablement le plus connu (car il bénéficie d'une jolie petite couverture médiatique), est un projet collaboratif dont le but est de construire une encyclopédie du vivant. Rien que ça !. L'idée étant de recenser un maximum d'espèce et d'en founir une description "systématique" sous forme de fiche. Merchi Ol Zava pour l'info !

C'est ici : EOL et c'est encore en développement.



Le second, dans la même fibre, propose la construction collaborative (entre plusieurs organismes scientifiques bienfaiteurs) d'une bibliothèque d'ouvrage menacés de disparition, relatant de la biodiversité, et de leur offrir ainsi une nouvelle vie.

C'est là : BHL et c'est encore un prototype

Et enfin, ce qui ne me regarde pas, mais me fascine, une constellation de liens concernant l'astronomie. Je vous renvoie directement sur les pages du blog ou je les ai trouvé, pour rendre à leur chouettes auteurs le fruit de leur travail : emob1 & emob2
Au programme : Stellarium, Exosolar, Wikisky et Neave Planet.

Bien à vous ! et faite vous plaisir en apprenant !

03 avril 2007

Y'en a qui rament.....

.... Il y en a qui publient dans Nature. Ca donne un caractère plutôt classe à la soutenance de thèse ! Chapeau docteur...

Nature 445, 908-911 (22 February 2007) doi:10.1038/nature05578; Received 18 October 2006; Accepted 4 January 2007
Moisture transport across Central America as a positive feedback on abrupt climatic changes
Guillaume Leduc, Laurence Vidal, Kazuyo Tachikawa, Frauke Rostek, Corinne Sonzogni, Luc Beaufort and Edouard Bard
CEREGE, UMR6635, CNRS Université Paul Cézanne Aix-Marseille III, Collège de France, Europôle de l'Arbois, BP 80, 13545 Aix-en-Provence Cedex 04, France

et moi ?? :-(
c'est pas en postant sur ce blog patati patata je sais.......

02 avril 2007

C'est petit et c'est grand...

Voici deux liens qui pointent vers l'infini..... à la fois très agréables à regarder, ce sont aussi de très bons suports didactiques. Je ne peux que.... vous les conseille !!!

Premier lien : un poster qui peux se télécharger au format jpeg avec tous les astres connus de plus de 200 miles dans le système solaire : "All (known) Bodies in the Solar System Larger than 200 Miles in Diameter"
Via http://kokogiak.com/




Deuxième lien : une application flash qui permet de se ballader de l'infini petit à l'infinimment grand : Universcale par Nikon via Emob



Voili voilou, n'hésitez pas à m'envoyer de tels liens si vous en avez que vous aimez particulièrement, fidèles lecteurs.